Le projet POSCOV dirigé par Marco Mendoza du laboratoire SysFate au sein du Genoscope, un centre de recherche basé en Ile-de-France spécialisé en génomique environnementale et plus particulièrement en séquençage massif d’ADN et bio-informatique, a pour objectif d’offrir une méthode de dépistage pour la Covid-19 à haute échelle. Pour ce faire, il s’appuie notamment sur des technologies de séquençage de haut débit (cf. Oxford Nanopore Sequencing). Plus précisément, trois aspects y sont abordés : l’évaluation de la sensibilité des dépistages en comparaison avec la méthode PCR, la détermination du nombre maximal d’échantillons qui peuvent être analysés simultanément sans porter atteinte à l’acuité de la méthode, l’évaluation de la capacité du processus à fonctionner dans des environnements via l’utilisation d’instruments spécifiques.
Le protocole suivi dans le cadre de ce projet consiste à marquer les échantillons à analyser (ARNs extraits avec des prélèvements nasopharyngés ou salivaires) en y indroduisant des codes-barres moléculaires. Ils sont par la suite mélangés et séquencés par le biais de la technologie Oxford Nanopore. Les données obtenues pourront ainsi être analysées informatiquement pour détecter les cas positifs.
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Dernière mise à jour
19.02.2021 - 13:48
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